ด้วย ราชินีมูลนิธิ ได้มอบหมายให้ ภาควิชาโบราณคดี คณะโบราณคดี มหาวิทยาลัยศิลปากร เป็นผู้ดำเนินการ "โครงการศึกษาวิจัยทางโบราณคดีบริเวณพื้นที่โรงเรียนราชินี" ในระหว่างวันที่ 10 เมษายน - 10 กรกฎาคม 2550 เป็นเวลา 30 วัน จากการศึกษาพบว่าพื้นที่บริเวณโรงเรียนราชินีและบริเวณใกล้เคียงมีความสำคัญในด้านประวัติศาสตร์และโบราณคดีเป็นอย่างมาก เนื่องจากเป็นบริเวณจุดยุทธศาสตร์ที่สำคัญในอดีต และตั้งอยู่ใจกลางของเกาะกรุงรัตนโกสินทร์ มีผู้คนอยู่อาศัยและใช้ประโยชน์จากพื้นที่นี้มายาวนานหลายชั่วอายุคน มีหลักฐานแสดงประวัติศาสตร์ความเป็นมาของพื้นมากมายที่สามารถค้นคว้าได้ตั้งแต่อยุธยาจนถึงปัจจุบัน การดำเนินงานทางทางโบราณคดีเป็นการศึกษาเรื่องราวต่างๆที่เกิดขึ้นในอดีต โดยศึกษาข้อมูลทั้งทางด้านประวัติศาสตร์พื้นที่รวมไปถึงการขุดค้นทางโบราณคดี อันทำให้ได้ข้อมูลทั้งทางด้านประวัติศาสตร์ ลักษณะทางสังคมวัฒนธรรม ตลอดจนลำดับพัฒนาการของผู้อยู่อาศัยและใช้พื้นที่มาแต่เดิม ตั้งแต่ก่อนเป็นโรงเรียนราชินีจวบจนกระทั่งเป็นโรงเรียนราชินีในปัจจุบัน รวมถึงหลักฐานประเภทโบราณวัตถุอันมีค่ายิ่งทำให้ทราบถึงกิจกรรมของผู้ที่เป็นเจ้าของพื้นที่และลักษณะสังคมวัฒนธรรมที่มาแต่อดีต โดยอาจจะกล่าวได้ว่าการศึกษาวิจัยทางโบราณคดีในบริเวณพื้นที่โรงเรียนราชินีเป็นส่วนหนึ่งของการ ศึกษาวิจัยด้าน "โบราณคดีกรุงเทพมหานคร" ข้อมูลทั้งหมดที่ได้จากการขุดค้นดังกล่าว เป็นหลักฐานสำคัญที่ทำให้คนในปัจจุบันได้ตระหนักถึงคุณค่าของอดีต อันนำมาซึ่งความเข้าใจในสิ่งที่เกิดขึ้นปัจจุบัน อันเป็นรากฐานที่มั่นคงในการพัฒนาบุคลากรและพัฒนาพื้นที่ตามแนวทางการอนุรักษ์และสร้างสรรค์ อีก ทั้งข้อมูลสำคัญดังกล่าวสามารถนำมาสร้างการเรียนรู้ประวัติความเป็นมาของพื้นที่อันจะเป็นประโยชน์ต่อสังคมในสมัยปัจจุบันด้วย