เรื่องราวความสนุกเริ่มต้นขึ้นเมื่อคุกกี้รสสตรอเบอร์รี่ย้ายมาโรงเรียนคุกกี้ วันแรกใคร ๆ ก็บอกเธอว่านักเรียนที่นี่ไม่ธรรมดา มาวันแรกเธอก็เจอเพื่อนถูกแกล้งเลย งานนี้คงอยู่เฉยไม่ได้แล้ว และในทุก ๆ ปีโรงเรียนคุกกี้จะจัดค่ายเอาชีวิตรอดสุดโหดอันเลื่องลือ เด็ก ๆ ทั้ง 3 ทีมต้องแข่งกันเอาชีวิตรอดในทะเลทราย ผลสุดท้ายทีมไหนจะชนะ ส่วนคุกกี้สาวผู้ร่าเริง ถึงจะเป็นเด็กเก่าแต่เธอก็เจอเรื่องราววุ่นวายใจระหว่างทำเวรทำความสะอดดเธอพบข้อความที่ซ่อนอยู่ของเพื่อนเก่า ครูคุกกี้นักพยากรณ์ นักแก้ปัญหาประจำโรงเรียนจึงต้องใช้หลักการวิทยาศาสตร์ช่วยครูและเด็ก ๆ นอกจากนี้ยังมีเรื่องราวสุดซ่าอีกเพียงรออยู่ในโรงเรียนคุกกี้แห่งนี้! "คุกกี้รันวิทย์ โรงเรียนวิทย์สุดซ่า เล่ม 16 (ฉบับการ์ตูน)" เล่มนี้ นำเสนอหลักการวิทยาศาสตร์ต่าง ๆ ที่ ซ่อนอยู่ในชีวิตประจำวัน อาทิ แรงเหวี่ยง สารละลาย การสะท้อนและการหักเหของ แสง ความร้อน และอีกมากมายผ่านเรื่องราวสุดสนุกของเหล่านักเรียนคุกกี้